近日，来自海军军医大学附属东方肝胆医院及国家肝癌科学中心的王红阳院士和付静教授团队，在《Journal of Hematology & Oncology》上发表了一项重要研究，利用单细胞转录组、空间转录组、类器官及小鼠模型，探讨了不同胆管癌亚型之间的细胞及微环境差异。研究中，他们鉴定出了一群eCCA特异性的基底样LY6D+肿瘤细胞亚群。富含ISG15分子的微环境被认为有助于提高eCCA细胞的干性、基底样特征和耐药性，进一步突显了其在维持LY6D+祖细胞生态位中的关键作用。这些发现为CCAs的新型预后生物标志物、治疗靶点及治疗策略的开发提供了重要依据。

发表信息： 发表时间：2025；期刊名称：《Journal of Hematology & Oncology》；影响因子：2.95；研究样本：慢性胆道炎症，iCCA，eCCA-P，eCCA-D；实验平台：scRNA-seq、空间ISS、PDO。

临床困局：解析胆管癌亚型异质性

胆管癌（CCA）被划分为肝内胆管癌（iCCA）和肝外胆管癌（eCCA）。eCCA又进一步细分为肝门部胆管癌（eCCA-P）和远端胆管癌（eCCA-D）。从胚胎学的角度看，iCCA源自肝母细胞，而eCCA则起源于前肠内胚层。然而，由于解剖位置的局限性，使得组织样本的获得变得困难，进而影响了其多组学层面的异质性研究。

研究思路

本研究采用了单细胞转录组测序对多种胆管癌亚型进行解析，以探索其异质性以及微环境的影响。

主要结论

1. 单细胞解析CCA亚型异质性图谱

通过对7例iBT、8例iCCA、9例eCCA-P和4例eCCA-D病人进行单细胞转录组测序，共获取109,071个细胞，注释分析后发现不同疾病和患者之间存在显著异质性。其中，eCCA-D亚型中显著富集施旺细胞和肥大细胞，而淋巴细胞主要在肿瘤样本中较为丰富。

2. CNV低的上皮细胞揭示CCA亚型的不同致癌驱动程序

对CNV低的上皮细胞进行亚群分析发现，在胆管癌中存在胃样、肠样和炎性样上皮细胞，表明其正常再生途径已被劫持。肿瘤中的CNV低上皮细胞在iCCAs、eCCA-Ps和eCCA-Ds中分别表现出间充质样、发育及免疫调节等细胞状态，提示不同CCA亚型的致癌过程可能由不同机制驱动。

3. 恶性肿瘤细胞不同的表达程序与肿瘤预后相关

进一步对恶性细胞进行NMF分析，识别出7个程序模块，其中iCCA显示出衰老程序，eCCA则表现为腺体和IFN响应程序。样本经过分类聚类后得到四种亚型，其中增殖亚型和IFN响应亚型与较差的预后相关，而衰老亚型则与更好的生存结果相关。

4. 类器官库药物筛选揭示治疗效果

研究人员利用类器官模型验证这四个亚型的精准治疗策略，建立16个类器官稳定株，并对175种化合物进行筛选。结果显示，IFN响应亚型显示出更高的耐药性，而衰老和腺体亚型通常表现出更高的药物敏感性。

5. 识别eCCA特异性LY6D+祖细胞亚群

通过恶性肿瘤细胞亚群分析及轨迹分析，发现c7群在eCCA中特有，具有发育和干性特征，并位于轨迹的起始端。相关基因LY6D的表达随着轨迹方向逐渐下降，表明c7群在生态位形成中的重要性。

6. LY6D+祖细胞生态位的维持依赖于ISG15富集的微环境

进一步分析基质微环境和免疫微环境的异质性，发现多种ISG15富集的细胞群在eCCA中高度富集。在基于类器官的功能实验中，ISG15被证明是维持癌细胞干性及增强其对各种抗癌药物抵抗力的重要因素，从而强调了LY6D+ EPCs祖细胞的生态位维持。

结论

本研究全面揭示了胆管癌的单细胞图谱及不同亚型的异质性，首次证明高表达ISG15的肿瘤微环境与eCCA特有LY6D+基底样祖细胞亚群的生态位形成之间的关联。这为精准癌症治疗的新靶点提供了重要线索，同时，南宫28NG相信品牌力量将继续支持相关领域的研究与发展。